RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PRAMEF10O60809 474 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CLDN7O95471 211 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 HLA-DQB2P05538 268 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CD82P27701 267 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 MAN1A1P33908 653 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 STC1P52823 247 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TAS2R40P59535 323 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 LRP8Q14114 963 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 MESDQ14696 234 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PCSK4Q6UW60 755 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TRIM74Q86UV6 250 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 NAGSQ8N159 534 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TTC9Q92623 222 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 DPYSL5Q9BPU6 564 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 KCNK4Q9NYG8 393 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 LRRD1A4D1F6 860 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 GBE1Q04446 702 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 LY6DQ14210 128 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 NR1D2Q14995 579 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TGIF1Q15583 401 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PYCR3Q53H96 274 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PATE1Q8WXA2 126 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SMIM14Q96QK8 99 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SLC38A3Q99624 504 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SOD1P00441 154 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 JCHAINP01591 159 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TMEM253P0C7T8 217 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 KDELR1P24390 212 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ETV5P41161 510 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CD86P42081 329 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 AP1B1Q10567 949 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PQLC3Q8N755 202 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 OR10G6Q8NH81 332 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 FAF2Q96CS3 445 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SGF29Q96ES7 293 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 RNF157Q96PX1 679 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 AGAP2Q99490 1192 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 NUDT22Q9BRQ3 303 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 B3GNT4Q9C0J1 378 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 APOL1O14791 398 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 PPM1DO15297 605 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 SLC2A4P14672 509 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 CD1CP29017 333 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 LIMK2P53671 638 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 GPLD1P80108 840 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 OR4D9Q8NGE8 314 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 RAPGEF5Q92565 580 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 MED8Q96G25 268 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 CCDC42Q96M95 316 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 TAAR9Q96RI9 348 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 LYSMD1Q96S90 227 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 RMI1Q9H9A7 625 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 DTLQ9NZJ0 730 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 VPS18Q9P253 973 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 NENFQ9UMX5 172 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 KCNK1O00180 336 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 EFSO43281 561 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 DUX1O43812 170 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-212ENST00000484841 PRLP01236 227 aa20■□□□□ 0.79
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