RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 GNAQP50148 359 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 OAZ1P54368 228 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 MFAP4P55083 255 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TFCP2Q12800 502 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TUBA3CQ13748 450 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 COG2Q14746 738 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PTPRRQ15256 657 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TCP11X2Q5H9J9 407 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TXNDC8Q6A555 127 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 JADE1Q6IE81 842 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TUBA3EQ6PEY2 450 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PRSS45Q7RTY3 260 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 GPAT4Q86UL3 456 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 IQCA1Q86XH1 822 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.78□□□□□ -1.48
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STRADBP1-201ENST00000478954 ASB10Q8WXI3 467 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
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STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 TXNRD2Q9NNW7 524 aa5.78□□□□□ -1.48
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STRADBP1-201ENST00000478954 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.78□□□□□ -1.48
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STRADBP1-201ENST00000478954 MYO10Q9HD67 2058 aa5.78□□□□□ -1.48
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC285556D6RIA3 1793 aa5.78□□□□□ -1.48
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STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 DENND2CQ68D51 928 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 AADACL2Q6P093 401 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 TICAM1Q8IUC6 712 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF276Q8N554 614 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 OR6J1Q8NGC5 347 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 TFAP2BQ92481 460 aa5.77□□□□□ -1.49
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STRADBP1-201ENST00000478954 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF347Q96SE7 839 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF341Q9BYN7 854 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 HAO1Q9UJM8 370 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 GTF3C4Q9UKN8 822 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 ICKQ9UPZ9 632 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 MYH3P11055 1940 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 PTPRSQ13332 1948 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP295Q9C0D2 2601 aa5.77□□□□□ -1.49
STRADBP1-201ENST00000478954 ZZEF1O43149 2961 aa5.76□□□□□ -1.49
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