RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC25A41Q8N5S1 370 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 NAT6Q93015 286 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 HIC2Q96JB3 615 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CARD9Q9H257 536 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TRABDQ9H4I3 376 aa14.68□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CEACAM5P06731 702 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 IVLP07476 585 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PSMB4P28070 264 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 DCDC1P59894 354 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC1A5Q15758 541 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 DOK6Q6PKX4 331 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL10Q8N8L6 244 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC110Q8TBZ0 833 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 AGAP2Q99490 1192 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SUFUQ9UMX1 484 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR34Q9UPC5 381 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ATRXP46100 2492 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SPEGQ15772 3267 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CPED1A4D0V7 1026 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 C5orf60A6NFR6 353 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 INPP4BO15327 924 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ASMTLO95671 621 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 JUPP14923 745 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GNPDA1P46926 289 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PEX6Q13608 980 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 HES3Q5TGS1 186 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ALS2CLQ60I27 953 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 KCTD16Q68DU8 428 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PDPK2PQ6A1A2 396 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM74Q86UV6 250 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 IFI44Q8TCB0 444 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 EID2BQ96D98 161 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 COX14Q96I36 57 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 WDR24Q96S15 920 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 FICDQ9BVA6 458 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ABCG4Q9H172 646 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GULP1Q9UBP9 304 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 U3KQA8 63 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 AKAP13Q12802 2813 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 IGF2RP11717 2491 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 MYF5P13349 255 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 HMGCLP35914 325 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 CHRNA4P43681 627 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 POLD2P49005 469 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 P3H1Q32P28 736 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GUSBP11Q6P575 273 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAM1L1Q8N609 369 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR26Q8NDV2 337 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 GATA6Q92908 595 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 OR2M4Q96R27 311 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 VPS18Q9P253 973 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 PADI4Q9UM07 663 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ACACAQ13085 2346 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP1-205ENST00000466097 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM149AA5PLN7 773 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP1-205ENST00000466097 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms