RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 TAS2R13Q9NYV9 303 aa15.95■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SLC7A1P30825 629 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 MYBPC1Q00872 1141 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CLCQ05315 142 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 KIF19Q2TAC6 998 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 RMDN1Q96DB5 314 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 LRCH3Q96II8 777 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 EXOC2Q96KP1 924 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ZBED2Q9BTP6 218 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SPON2Q9BUD6 331 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 NBNO60934 754 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 GJB5O95377 273 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CAPN3P20807 821 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 LCP2Q13094 533 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SATL1Q86VE3 508 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CNBD2Q96M20 576 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 BIRC8Q96P09 236 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 TCF12Q99081 682 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 EPB41L1Q9H4G0 881 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 GALPQ9UBC7 116 aa15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 C7orf72A4D263 438 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 H0YJX3 145 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ECI2O75521 394 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 F11P03951 625 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 TFAP2AP05549 437 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CLCN2P51788 898 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 OXCT1P55809 520 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 NME5P56597 212 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ATP6V0D1P61421 351 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CYTH1Q15438 398 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 TSNQ15631 228 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 GEN1Q17RS7 908 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 PITRM1Q5JRX3 1037 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 HERC6Q8IVU3 1022 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 MFN1Q8IWA4 741 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 AHI1Q8N157 1196 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 FBXO39Q8N4B4 442 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 EME1Q96AY2 570 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ABCD2Q9UBJ2 740 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 POLG2Q9UHN1 485 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 RNF112Q9ULX5 631 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 H7C4K7 107 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SUPT3HO75486 399 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CSPG5O95196 566 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 PGM3O95394 542 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 MATN4O95460 622 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SLC11A2P49281 568 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SGSHP51688 502 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CREB5Q02930 508 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 DDIASQ8IXT1 998 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 MIER2Q8N344 545 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 GPR21Q99679 349 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SLC30A3Q99726 388 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 COQ10BQ9H8M1 238 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SLC52A3Q9NQ40 469 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 LZTS1Q9Y250 596 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 NDUFAF1Q9Y375 327 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 AK5Q9Y6K8 562 aa15.93■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PQY0 241 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 CDC7O00311 574 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 NR5A2O00482 541 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ADAM12O43184 909 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 KLKB1P03952 638 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 GALTP07902 379 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 LINC00032P0C843 101 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 LBPP18428 481 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 RAD51Q06609 339 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 VPS26BQ4G0F5 336 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 FBXO48Q5FWF7 155 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 DENND1CQ8IV53 801 aa15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF597Q96LX8 424 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms