RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LGR4Q9BXB1 951 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 STK33Q9BYT3 514 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 KLQ9UEF7 1012 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 APPL1Q9UKG1 709 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MAST4O15021 2626 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 WASH4PA8MWX3 477 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CCP110O43303 1012 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TNFP01375 233 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 JMJD7P0C870 316 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CCL4P13236 92 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 EPHB2P29323 1055 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 BLKP51451 505 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 JAM2P57087 298 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 OGDHQ02218 1023 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MTM1Q13496 603 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 GKN2Q86XP6 184 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NRROSQ86YC3 692 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MLKLQ8NB16 471 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM74Q96NL1 305 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 STRADBQ9C0K7 418 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC19Q9H756 370 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FZD10Q9ULW2 581 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SDK2Q58EX2 2172 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 B4DGG1 531 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CREB3O43889 395 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MBD3O95983 291 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 KRT3P12035 628 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 GPD1P21695 349 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 HTR1BP28222 390 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM23P36406 574 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MAPK10P53779 464 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 OR1D5P58170 312 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA1024LP59773 190 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RAD51Q06609 339 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ELP6Q0PNE2 266 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CA9Q16790 459 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 C14orf28Q4W4Y0 310 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 COLEC12Q5KU26 742 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MANEAQ5SRI9 462 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LIPIQ6XZB0 460 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF677Q86XU0 584 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RDH14Q9HBH5 336 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 A8MX80 341 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PRAMEF11O60813 436 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms