RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITIH5Q86UX2 942 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIPK4Q8NE63 616 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMGCLL1Q8TB92 370 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAG3L4Q8TBR4 150 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HACD3Q9P035 362 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.63■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0U1RQS6 177 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC14BA6NHZ5 514 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H7C0S8 307 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FZD6O60353 706 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1I1O60431 355 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA31D3P0C874 917 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GFAPP14136 432 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFC2P35250 354 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THOP1P52888 689 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ART3Q13508 389 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF111Q6ZNA4 994 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLYBLQ8N0X4 340 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DCAF4L2Q8NA75 395 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BHMTQ93088 406 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf60Q96EN9 201 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPAS2Q99743 824 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALPQ9UBC7 116 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF112Q9ULX5 631 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1671Q9BY89 1806 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP6CO00743 305 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PFDN6O15212 129 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MT-CO1P00395 513 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PYGLP06737 847 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPP6P42658 865 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KBTBD6Q86V97 674 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM217AQ8IXS0 508 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC16Q8NEE8 873 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MID1IP1Q9NPA3 183 aa18.62■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUPT3HB4E1H0 165 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS26AO75436 327 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUPT3HO75486 399 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPC4O75487 556 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGF4P08620 206 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTK2BQ14289 1009 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTSL3PQ5NE16 218 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC30A3Q99726 388 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAFFQ9ULX9 164 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF711Q9Y462 761 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DENND4CQ5VZ89 1909 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A6NHS1 94 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 K7ERQ8 282 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CFLARO15519 480 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NIPSNAP2O75323 286 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ECI2O75521 394 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6AP2O75787 350 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD9P21926 228 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CEACAM7Q14002 265 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPRE2Q15555 327 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IZUMO2Q6UXV1 221 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFN1Q8IWA4 741 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO39Q8N4B4 442 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C3orf30Q96M34 536 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL17CQ9P0M4 197 aa18.61■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC7O00311 574 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF12O95522 483 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPAN12O95859 305 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLTBP09497 229 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GABRR2P28476 465 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLCN4P51793 760 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKNOX1P55347 436 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR5P61964 334 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP1S1P61966 158 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP4F8P98187 520 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAREM2Q75VX8 874 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APCDD1Q8J025 514 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TM6SF2Q9BZW4 377 aa18.6■□□□□ 0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms