RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417088.2

RPS28-201, Transcript of ribosomal protein S28, humanhuman

TSL 2

Gene RPS28, Length 334 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28-201ENST00000417088 ZNF30P17039 623 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 ZNF165P49910 485 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 ARSEP51690 589 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 STC1P52823 247 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 DSC2Q02487 901 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 GALNT2Q10471 571 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 NUP85Q9BW27 656 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 KCNK4Q9NYG8 393 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 CHKBQ9Y259 395 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.73□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 MATN3O15232 486 aa14.72□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 EML2O95834 649 aa14.72□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 FASLGP48023 281 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 ATP1A2P50993 1020 aa14.72□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 CCDC122Q5T0U0 273 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.72□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 EXD1Q8NHP7 514 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 WDR24Q96S15 920 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 DDA1Q9BW61 102 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 SLC12A9Q9BXP2 914 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 A0A087X0T9 212 aa14.71□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 MAP3K6O95382 1288 aa14.71□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 FAM228BP0C875 321 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 CES1P23141 567 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS28-201ENST00000417088 UGT1A3P35503 534 aa14.71□□□□□ -0.05
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RPS28-201ENST00000417088 SUV39H1O43463 412 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 SERPING1P05155 500 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 CCNCP24863 283 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 PBX1P40424 430 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 TSPAN7P41732 249 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 CSRP3P50461 194 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 RPL26P61254 145 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS28-201ENST00000417088 FAM129CQ86XR2 697 aa14.7□□□□□ -0.06
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