RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 TXNDC9O14530 226 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 AZIN1O14977 448 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ACSL4O60488 711 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TLR5O60602 858 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PMLP29590 882 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 SH3BP2P78314 561 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 GNA12Q03113 381 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 OR52K2Q8NGK3 314 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ZUFSPQ96AP4 578 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TMEM45AQ9NWC5 275 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R13Q9NYV9 303 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PADI4Q9UM07 663 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 AP4B1Q9Y6B7 739 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PTPRSQ13332 1948 aa23.7■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 STAMBPO95630 424 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ALDH2P05091 517 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 FPGSQ05932 587 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 RNF148Q8N7C7 305 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PBXIP1Q96AQ6 731 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 AKTIPQ9H8T0 292 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 DNMT3LQ9UJW3 386 aa23.69■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 SYCE1LA8MT33 242 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 KDELR3O43731 214 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TNFAIP8O95379 198 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 SEMA3AQ14563 771 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 MGAT5BQ3V5L5 792 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 CLEC6AQ6EIG7 209 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 FUNDC1Q8IVP5 155 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 LGI2Q8N0V4 545 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 LPGAT1Q92604 370 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PIDD1Q9HB75 910 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PRORSD1PA6NEY8 169 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 CCL22O00626 93 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 STX16O14662 325 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PFDN6O15212 129 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 SLC11A2P49281 568 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 FOXM1Q08050 763 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 OR4D1Q15615 310 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TMEM240Q5SV17 173 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 OGFOD2Q6N063 350 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 MINDY1Q8N5J2 469 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 OR13C4Q8NGS5 318 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PFDN4Q9NQP4 134 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ABCD2Q9UBJ2 740 aa23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 KLK8O60259 260 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 CLDN11O75508 207 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 VNN2O95498 520 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 SLC4A1P02730 911 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 HMBSP08397 361 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 CR2P20023 1033 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 RPL5P46777 297 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 DEFB103AP81534 67 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 RAD51Q06609 339 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 LCP2Q13094 533 aa23.67■■□□□ 1.38
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PMS1-205ENST00000409985 IL23RQ5VWK5 629 aa23.67■■□□□ 1.38
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PMS1-205ENST00000409985 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ABI1Q8IZP0 508 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 MIER2Q8N344 545 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 GPR152Q8TDT2 470 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TWIST2Q8WVJ9 160 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.67■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ILVBLA1L0T0 632 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 PYGLP06737 847 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 LBPP18428 481 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 IKBKEQ14164 716 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 GALNT3Q14435 633 aa23.66■■□□□ 1.38
PMS1-205ENST00000409985 ADRM1Q16186 407 aa23.66■■□□□ 1.38
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