RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 DNAJB2P25686 324 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 FMO3P31513 532 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 RXRGP48443 463 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 CCL23P55773 120 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 ARHGEF7Q14155 803 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 GPR162Q16538 588 aa8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 OR2T3Q8NH03 318 aa8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 UBR3Q6ZT12 1888 aa8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 DPYSL4O14531 572 aa8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 TPD52L3Q96J77 140 aa8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 TMEM135Q86UB9 458 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 UBE2J2Q8N2K1 259 aa8.3□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 DDI1Q8WTU0 396 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.3□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 TGFBR1P36897 503 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 HSPA7P48741 367 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 KCNQ1P51787 676 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 OR4D2P58180 307 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 ZXDBP98169 803 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 CBX3Q13185 183 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 PTGR1Q14914 329 aa8.29□□□□□ -1.08
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SNX13-201ENST00000409076 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 GLYATQ6IB77 296 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 FAM151BQ6UXP7 276 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 ADCK1Q86TW2 530 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 RNF175Q8N4F7 328 aa8.29□□□□□ -1.08
SNX13-201ENST00000409076 ITFG1Q8TB96 612 aa8.29□□□□□ -1.08
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