RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF853P0CG23 659 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 DDX5P17844 614 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 GSCP56915 257 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 DRP2Q13474 957 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ACVR2BQ13705 512 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF79Q15937 498 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIPR1Q53HC9 387 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 PPP4R4Q6NUP7 873 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCDC149Q6ZUS6 474 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 C11orf96Q7Z7L8 435 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 LSMEM2Q8N112 164 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ADSSL1Q8N142 457 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 GHDCQ8N2G8 530 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAB42Q8N4Z0 105 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 C11orf42Q8N5U0 333 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 MIPOL1Q8TD10 442 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 PIGSQ96S52 555 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 TEX13BQ9BXU2 312 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 MYO1AQ9UBC5 1043 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 PTPRCP08575 1304 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC22A2O15244 555 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 PCNAP12004 261 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 BDKRB2P30411 391 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 GJC1P36383 396 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 RUNX2Q13950 521 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 KIAA0753Q2KHM9 967 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 HLA-BQ31612 363 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRT77Q7Z794 578 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ISCA2Q86U28 154 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 GLIS1Q8NBF1 620 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC2A12Q8TD20 617 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZFAND2BQ8WV99 257 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ARRDC3Q96B67 414 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 HOOK2Q96ED9 719 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSMB7Q99436 277 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 RHNO1Q9BSD3 238 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 GNB4Q9HAV0 340 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 SPC25Q9HBM1 224 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 FLT1P17948 1338 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 MUC6Q6W4X9 2439 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 H0YIN7 160 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLCO2B1O94956 709 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 HPP00738 406 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 LYL1P12980 280 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 BCL3P20749 454 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLRK1P26718 216 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM193AP78312 1265 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 E2F5Q15329 346 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 MMEL1Q495T6 779 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 SYCP2LQ5T4T6 812 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 SDE2Q6IQ49 451 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 TSPAN33Q86UF1 283 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 Q8NBF4 154 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR2AK2Q8NG84 335 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 HERVK_113Q902F9 699 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 NCSTNQ92542 709 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 TMEM143Q96AN5 459 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 PHYHIPLQ96FC7 376 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 ZNF570Q96NI8 536 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 C1orf112Q9NSG2 853 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-187P-201ENST00000384139 FAM234BA2RU67 622 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 C9P02748 559 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ITGAXP20702 1163 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 ELF1P32519 619 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAPK9P45984 424 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MTNR1AP48039 350 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 NEK2P51955 445 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 MBTD1Q05BQ5 628 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 IL13RA2Q14627 380 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 KLHL17Q6TDP4 642 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 IQCHQ86VS3 1027 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHD1LQ86WJ1 897 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 CD177Q8N6Q3 437 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 GJC3Q8NFK1 279 aa0.77□□□□□ -2.29
RNU6-187P-201ENST00000384139 RDM1Q8NG50 284 aa0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms