RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383872.1

RNU6-841P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 841, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-841P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 KRTCAP3Q53RY4 240 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 TSPO2Q5TGU0 170 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 AGAP6Q5VW22 663 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 Q5XG85 94 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 FBXW10Q5XX13 1052 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ACSM2BQ68CK6 577 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 WDR93Q6P2C0 686 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 WDR59Q6PJI9 974 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 FOXR2Q6PJQ5 311 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 Q6ZRU5 148 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 FRMD7Q6ZUT3 714 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 UNC13DQ70J99 1090 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 Q71RC1 249 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 LRRC8DQ7L1W4 858 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 FAM220AQ7Z4H9 259 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 C5orf24Q7Z6I8 188 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 NOXA1Q86UR1 476 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 GPBP1Q86WP2 473 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 SFR1Q86XK3 245 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 RDH10Q8IZV5 341 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 Q8N1Y9 231 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 FAM19A2Q8N3H0 131 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF525Q8N782 197 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 RGS22Q8NE09 1264 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 GSTCDQ8NEC7 633 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 RFWD2Q8NHY2 731 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 SH3TC2Q8TF17 1288 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ATP8B4Q8TF62 1192 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 LRRC15Q8TF66 581 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 HDAC7Q8WUI4 952 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 PHYHIPQ92561 330 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 TMBIM1Q969X1 311 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 CEP95Q96GE4 821 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF597Q96LX8 424 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 LRFN5Q96NI6 719 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 NEUROD6Q96NK8 337 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 GUCD1Q96NT3 240 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 AGAP4Q96P64 663 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 CSPG4P5Q96PW8 444 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 KIF2CQ99661 725 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 DSCC1Q9BVC3 393 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 FUT8Q9BYC5 575 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 OR10A5Q9H207 317 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 CAPN10Q9HC96 672 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 GPR35Q9HC97 309 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ABCB6Q9NP58 842 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 UBN1Q9NPG3 1134 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 RASSF1Q9NS23 344 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 TMEM30AQ9NV96 361 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 PANK4Q9NVE7 773 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 SOHLH2Q9NX45 425 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 MIOSQ9NXC5 875 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 GALNT8Q9NY28 637 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 CFAP97Q9P2B7 532 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 DNAI1Q9UI46 699 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF221Q9UK13 617 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 DNPEPQ9ULA0 475 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 TPCN1Q9ULQ1 816 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 USP18Q9UMW8 372 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 SATB2Q9UPW6 733 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 CLCA2Q9UQC9 943 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 PIAS3Q9Y6X2 628 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 HEG1Q9ULI3 1381 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 SCN4AP35499 1836 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 UTYO14607 1347 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 A0A087WW49 117 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 A0A096LNJ9 63 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 A0A1W2PNM2 257 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 MYBPHLA2RUH7 354 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 C7orf66A4D0T2 115 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ASPDHA6ND91 283 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-841P-201ENST00000383872 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa-1.56□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms