RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 STRA6Q9BX79 667 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP28Q9H239 520 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL1Q9NR64 748 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF1P21675 1872 aa3.04□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PRG0 241 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PS18 150 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASPDHA6ND91 283 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 LILRA5A6NI73 299 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPINT2O43291 252 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TGFB1I1O43294 461 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CREB3O43889 395 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF17O60258 216 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SP1P08047 785 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPARCP09486 303 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXC9P31274 260 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 BSGP35613 385 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FMO5P49326 533 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 F2RL1P55085 397 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHEXP78562 749 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF234Q14588 700 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC96Q2M329 555 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCST1Q5T197 706 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR180Q86V85 440 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM116Q8NCL8 245 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC38A5Q8WUX1 472 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGTQ969N2 578 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAAR8Q969N4 342 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGSF8Q969P0 613 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYT17Q9BSW7 474 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFP57Q9NU63 452 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAAR2Q9P1P5 351 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 MDFICQ9P1T7 246 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PADI3Q9ULW8 664 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF711Q9Y462 761 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.03□□□□□ -1.92
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPRCP08575 1304 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR81Q562E7 1941 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC189A1A4V9 331 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 P2RY10O00398 339 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPN9O14815 690 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR1O75083 606 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MARK3P27448 753 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELF1P32519 619 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT9P35527 623 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PBX3P40426 434 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS2P41220 211 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ISL1P61371 349 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 DECR1Q16698 335 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDONQ4KMG0 1287 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTI2Q6NXR4 508 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRROSQ86YC3 692 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5R1Q8NH85 324 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMGCLL1Q8TB92 370 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 THAP6Q8TBB0 222 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 RFFLQ8WZ73 363 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 APBB2Q92870 758 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms