RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 PRUNE1Q86TP1 453 aa26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 SLC35F3Q8IY50 421 aa26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 SUFUQ9UMX1 484 aa26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa26.83■■□□□ 1.89
TPGS1-201ENST00000359315 LRP4O75096 1905 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 CKMT1AP12532 417 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 SNX1Q13596 522 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ELOCQ15369 112 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 RANBP10Q6VN20 620 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 HIC2Q96JB3 615 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 BOCQ9BWV1 1114 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ARFGAP3Q9NP61 516 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 SIRPGQ9P1W8 387 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ST14Q9Y5Y6 855 aa26.82■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 RGSL1A5PLK6 1076 aa26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 FGF1P05230 155 aa26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 GNPDA1P46926 289 aa26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 DCDC1P59894 354 aa26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 PRPSAP1Q14558 356 aa26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 GUSBP11Q6P575 273 aa26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 RTP4Q96DX8 246 aa26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa26.81■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 FAM149AA5PLN7 773 aa26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 USP27XA6NNY8 438 aa26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 FGGP02679 453 aa26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 PTPRCAPQ14761 206 aa26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 DENND5AQ6IQ26 1287 aa26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 NRROSQ86YC3 692 aa26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 KYQ8NBH2 561 aa26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA16Q9BXB7 569 aa26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 DOLKQ9UPQ8 538 aa26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 CASC3O15234 703 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 CEP104O60308 925 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 IVLP07476 585 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ETS1P14921 441 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 PARP6Q2NL67 630 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 KCTD11Q693B1 232 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 TAF8Q7Z7C8 310 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 SLC35F6Q8N357 371 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 GLIS1Q8NBF1 620 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 IL17CQ9P0M4 197 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa26.79■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 GPR39O43194 453 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 PYGLP06737 847 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 AK4P27144 223 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 HMGCLP35914 325 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 GKN2Q86XP6 184 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 TRAM1L1Q8N609 369 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 TBL1YQ9BQ87 522 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 TRABDQ9H4I3 376 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 GPR34Q9UPC5 381 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 PRKAB1Q9Y478 270 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 KCTD3Q9Y597 815 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ARL5AQ9Y689 179 aa26.78■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 CPED1A4D0V7 1026 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ASMTLO95671 621 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 CA5AP35218 305 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ADCY8P40145 1251 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 NR0B2Q15466 257 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF569Q5MCW4 686 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 PERM1Q5SV97 790 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 MICALCLQ6ZW33 695 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 IFI44Q8TCB0 444 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 OR2M4Q96R27 311 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 IL26Q9NPH9 171 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 HACD3Q9P035 362 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 GULP1Q9UBP9 304 aa26.77■■□□□ 1.88
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF148Q9UQR1 794 aa26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms