RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 PLK4O00444 970 aa11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TPST2O60704 377 aa11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CAPN15O75808 1086 aa11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ICAM3P32942 547 aa11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SP140Q13342 867 aa11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 P2RY8Q86VZ1 359 aa11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PARGQ86W56 976 aa11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SPATA13Q96N96 652 aa11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 AZIN1O14977 448 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 KCNQ2O43526 872 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ORC5O43913 435 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ANGPTL1O95841 491 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CCNCP24863 283 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CCR10P46092 362 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF180Q86T96 592 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 OR5T3Q8NGG3 340 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CXorf40AQ8TE69 158 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 KAT2AQ92830 837 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 BRD9Q9H8M2 597 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PTTG2Q9NZH5 202 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 NARSO43776 548 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 OTCP00480 354 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CTSEP14091 401 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CCNB1P14635 433 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MFSD5Q6N075 450 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 EXOC2Q96KP1 924 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SERPINB11Q96P15 392 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ALG5Q9Y673 324 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 NOBOXO60393 691 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PAEPP09466 180 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CTPS1P17812 591 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PRELID2Q8N945 189 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TRIM2Q9C040 744 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 NECTIN3Q9NQS3 549 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TNFRSF11BO00300 401 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PGAM2P15259 253 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 AKT2P31751 481 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SREBF1P36956 1147 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 YAP1P46937 504 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 DCDC1P59894 354 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MAMLD1Q13495 774 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RAET1GQ6H3X3 334 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 USP43Q70EL4 1123 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CLNKQ7Z7G1 428 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PHC2Q8IXK0 858 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 OR10H5Q8NGA6 315 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MCMBPQ9BTE3 642 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 EBF2Q9HAK2 575 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TBX1O43435 398 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SAGP10523 405 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 LHCGRP22888 699 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MMP14P50281 582 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 CCL15Q16663 113 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SNX33Q8WV41 574 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC35C1Q96A29 364 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 TCF25Q9BQ70 676 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 EBF3Q9H4W6 596 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM86C2PA6NEL3 165 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 EPHB6O15197 1021 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PGLSO95336 258 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 PIRTP0C851 137 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 GNALP38405 381 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 RAB27AP51159 221 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 AQP4P55087 323 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ACAP2Q15057 778 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF567Q8N184 647 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 C7orf57Q8NEG2 295 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 ADCY4Q8NFM4 1077 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 MROH8Q9H579 483 aa10.99□□□□□ -0.65
GTF3C1-201ENST00000356183 LRRC19Q9H756 370 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms