RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 EPOP01588 193 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GPIP06744 558 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 C7P10643 843 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 FCGR1AP12314 374 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 HGFP14210 728 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 MYF6P23409 242 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 ETFBP38117 255 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 PBX3P40426 434 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 SEMA3AQ14563 771 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 DSC3Q14574 896 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 TYSND1Q2T9J0 566 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GNASQ5JWF2 1037 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 OGFOD2Q6N063 350 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 CXCL17Q6UXB2 119 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 MYRFLQ96LU7 910 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 SMOXQ9NWM0 555 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC14BA6NHZ5 514 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM64CA6NLI5 447 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 F8W810 466 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 ARPC2O15144 300 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 SERINC3Q13530 473 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 OR4L1Q8NH43 312 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 BRSK1Q8TDC3 778 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GAB3Q8WWW8 586 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA1191Q96A73 305 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 TMIGD2Q96BF3 282 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 BIRC8Q96P09 236 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 KCNA7Q96RP8 456 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 ADI1Q9BV57 179 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 EGFL7Q9UHF1 273 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 CLEC11AQ9Y240 323 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 A0A087WXM4 84 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 NAA20P61599 178 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 EFEMP1Q12805 493 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 FBXL22Q6P050 247 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA19Q7Z5L4 167 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRG5Q8IZF4 528 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 FBXO39Q8N4B4 442 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 STAG3L4Q8TBR4 150 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 IGSF8Q969P0 613 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 C8orf48Q96LL4 319 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 DERL2Q9GZP9 239 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GMIPQ9P107 970 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 RNF112Q9ULX5 631 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 DYTNA2CJ06 578 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 SUPT3HB4E1H0 165 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 DLGAP1O14490 977 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 SUPT3HO75486 399 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 IGHA2P01877 340 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 LINC00032P0C843 101 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 CCT8P50990 548 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 CLCQ05315 142 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF235Q14590 738 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 ATP6AP1Q15904 470 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 RAP1GAP2Q684P5 730 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 OR13C4Q8NGS5 318 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 ADAM2Q99965 735 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 BTRCQ9Y297 605 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GPR45Q9Y5Y3 372 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 CRCPO75575 148 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 OXTRP30559 389 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 THPOP40225 353 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 ESRRGP62508 458 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GRIK2Q13002 908 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 RCAN2Q14206 197 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GALNT3Q14435 633 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 PTPRCAPQ14761 206 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 TMTC4Q5T4D3 741 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 A0A1W2PP18 115 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 LCHNA4D1U4 455 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 DRGXA6NNA5 263 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 C9JVG2 144 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 PRAMEF11O60813 436 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-201ENST00000355530 GJB3O75712 270 aa18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms