RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 CCNCP24863 283 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CBLBQ13191 982 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 AHSA2Q719I0 299 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 TMC8Q8IU68 726 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 RBFAQ8N0V3 343 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 WDR48Q8TAF3 677 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CRELD1Q96HD1 420 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PET100P0DJ07 73 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 KIR3DL1P43629 444 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 MIB1Q86YT6 1006 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 UFD1Q92890 307 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ACKR2O00590 384 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 MAP3K6O95382 1288 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 MT-CO1P00395 513 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 DNAJB1P25685 340 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 RHBDF1Q96CC6 855 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 NDST1P52848 882 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 LCP2Q13094 533 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 FGFR2P21802 821 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 FMO4P31512 558 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 MOGQ16653 247 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CA9Q16790 459 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 TBC1D24Q9ULP9 559 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 TPTEP56180 551 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 MAB21L1Q13394 359 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 SH2D3AQ9BRG2 576 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 RGL2O15211 777 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 NR2F1P10589 423 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 RBL1P28749 1068 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 GPR162Q16538 588 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 RIT1Q92963 219 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 FAM136AQ96C01 138 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 METTL7BQ6UX53 244 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 UNC5AQ6ZN44 842 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 SPATA20Q8TB22 786 aa16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 GAKO14976 1311 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 TRIM64CA6NLI5 447 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 DNM1LO00429 736 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 SLC9A6Q92581 669 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PXMP2Q9NR77 195 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 IRF1P10914 325 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 SLC15A1P46059 708 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PRMT3O60678 531 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ARF5P84085 180 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PEX6Q13608 980 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 C11orf65Q8NCR3 313 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 BIRC8Q96P09 236 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CKMP06732 381 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 UROSP10746 265 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 AGBL3Q8NEM8 1001 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 SYT15Q9BQS2 421 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 TMEM134Q9H6X4 195 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 CYP3A7P24462 503 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PNLIPRP1P54315 467 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 FOXM1Q08050 763 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 TMEM17Q86X19 198 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 SLC34A3Q8N130 599 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 THRSPQ92748 146 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 PLIN3O60664 434 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 IFNW1P05000 195 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 AQP12BA6NM10 295 aa16.86■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 H7C2Y5 167 aa16.86■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 GLDCP23378 1020 aa16.86■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 ACSL1P33121 698 aa16.86■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.86■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 AQP12AQ8IXF9 295 aa16.86■□□□□ 0.29
HCN1-201ENST00000303230 FAM84AQ96KN4 292 aa16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms