RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 XPR1Q9UBH6 696 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 L1RE1Q9UN81 338 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 TLR5O60602 858 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 PLGP00747 810 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ENPEPQ07075 957 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CTBP1Q13363 440 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GPR158Q5T848 1215 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CADM2Q8N3J6 435 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 DNAJC18Q9H819 358 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 PFDN2Q9UHV9 154 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ALADP13716 330 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GCNT1Q02742 428 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 VGLL4Q14135 290 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 BEND5Q7L4P6 421 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC36Q8IYA8 594 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 PORCNQ9H237 461 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 MDM4O15151 490 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 FGF19O95750 216 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 OAZ1P54368 228 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 CBX3Q13185 183 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 TEAD4Q15561 434 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 FAM35AQ86V20 835 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 HCAR2Q8TDS4 363 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 MTMR9Q96QG7 549 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 GRM6O15303 877 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 MAPK14Q16539 360 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 KAT2AQ92830 837 aa16.4■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 TRBC1P01850 177 aa16.39■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 C12orf4Q9NQ89 552 aa16.39■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ERVK-11Q9UQG0 969 aa16.39■□□□□ 0.22
LAMC1-201ENST00000258341 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 H3BM21 787 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 CHST10O43529 356 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 ATP6AP2O75787 350 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 AADACL2Q6P093 401 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 WDR59Q6PJI9 974 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 TPK1Q9H3S4 243 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 GLUD1P00367 558 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 CDKL1Q00532 357 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 SNAPC1Q16533 368 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 FIGNQ5HY92 759 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 ANKFN1Q8N957 763 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 BPNT1O95861 308 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 C2orf80Q0P641 193 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 ERICH5Q6P6B1 374 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 MBOAT7Q96N66 472 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 FUT8Q9BYC5 575 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 SH3D21A4FU49 640 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 LAMP2P13473 410 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 VLDLRP98155 873 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 SNX33Q8WV41 574 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 PHF12Q96QT6 1004 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 MAFFQ9ULX9 164 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 WASP42768 502 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 INHBEP58166 350 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 RPL19P84098 196 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 LNX2Q8N448 690 aa16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.39■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 CDC25CP30307 473 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF844Q08AG5 666 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 CERCAMQ5T4B2 595 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 CALCAP01258 141 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 COX4I1P13073 169 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 CTSKP43235 329 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 PSMD5Q16401 504 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 C5orf22Q49AR2 442 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 BICRALQ6AI39 1079 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 C10orf107Q8IVU9 208 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 PIK3C3Q8NEB9 887 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 LTN1O94822 1766 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 RIIAD1A6NNX1 92 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 SLC22A3O75751 556 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 FAM153BP0C7A2 387 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 TTKP33981 857 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 PTPN9P43378 593 aa16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
LAMC1-201ENST00000258341 PRKG2Q13237 762 aa16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms