RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ARTNQ5T4W7 220 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PKN3Q6P5Z2 889 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 LGI2Q8N0V4 545 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MRGBPQ9NV56 204 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf42Q9NWW7 574 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 VTI1BQ9UEU0 232 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PSAT1Q9Y617 370 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD54BQ9Y620 910 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM44O43615 452 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 AVPR2P30518 371 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ARRB2P32121 409 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCN5P51795 746 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL22Q6P050 247 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC14AQ86T13 490 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 IGSF8Q969P0 613 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 DCUN1D1Q96GG9 259 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 LRGUKQ96M69 825 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 VANGL2Q9ULK5 521 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC100653049A0A140TA62 436 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEB16A2A368 324 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EQS6 105 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNDC9O14530 226 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TBL1XO60907 577 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT34O76011 436 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFAIP8O95379 198 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CISD3P0C7P0 127 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC2A3P11169 496 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 DCLK2Q8N568 766 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SYBUQ9NX95 663 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PADI4Q9UM07 663 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 RAP2CQ9Y3L5 183 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8OA6NCC3 632 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8NF8WBI6 632 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB14O43829 449 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIA2P42262 883 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CNGA3Q16281 694 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MPPE1Q53F39 396 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM81AQ8TBF8 368 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MSANTD3Q96H12 275 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF696Q9H7X3 374 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FZD10Q9ULW2 581 aa26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KMT2EQ8IZD2 1858 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 G3V2L1 256 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KAT7O95251 611 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CLPTM1O96005 669 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPNS1P04632 268 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CREB5Q02930 508 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
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CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1JQ5JR12 505 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 BRMS1LQ5PSV4 323 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG14Q6ZNE5 492 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF781Q8N8C0 355 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.86e-6■■■■■ 47.7
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CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN23Q96B33 292 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 HIC2Q96JB3 615 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 DEC1Q9P2X7 70 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO10Q9UK96 956 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 HCN2Q9UL51 889 aa26.28■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PRRT4C9JH25 899 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM72CH0Y354 149 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 MATN2O00339 956 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 HDAC3O15379 428 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC13P55735 322 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM72AQ5TYM5 149 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM72DQ6L9T8 149 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL19Q6PCT2 694 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM135Q86UB9 458 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM72BQ86X60 149 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 NELL2Q99435 816 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 AP3B1O00203 1094 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CYBBP04839 570 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM18P0DKX4 95 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 GOT1P17174 413 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3R1P27986 724 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ADRA1BP35368 520 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CRADDP78560 199 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 GEN1Q17RS7 908 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 BORAQ6PGQ7 559 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PGAM4Q8N0Y7 254 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 PYROXD2Q8N2H3 581 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRN4Q8WUT4 740 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 OXSMQ9NWU1 459 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 BFARQ9NZS9 450 aa26.27■■□□□ 1.8
CAPNS1-201ENST00000246533 HACD3Q9P035 362 aa26.27■■□□□ 1.8
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