RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635538.1

EP300-208, Transcript of E1A binding protein p300, human

TSL 2

Gene EP300, Length 318 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EP300-208	ENST00000635538	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MAP2K7	O14733	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PSG1	P11464	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	STX2	P32856	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HSD17B4	P51659	736 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PGGT1B	P53609	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PPAT	Q06203	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DSC1	Q08554	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PCLAF	Q15004	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ETFDH	Q16134	617 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HSPA12A	O43301	675 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	RGS14	O43566	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GAGE7	O76087	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ADRB2	P07550	413 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	PIGA	P37287	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	AMT	P48728	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GPR143	P51810	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	STAT2	P52630	851 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GAGE1	Q13065	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	GAGE4	Q13068	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	KCNC3	Q14003	757 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	NRAC	Q8N912	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	MCU	Q8NE86	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
EP300-208	ENST00000635538	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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