RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 POLBP06746 335 aa8.49□□□□□ -1.05
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SGMS1-211ENST00000626236 PGAM1P18669 254 aa8.49□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SPAM1P38567 509 aa8.49□□□□□ -1.05
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SGMS1-211ENST00000626236 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 NELL1Q92832 810 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 FOXJ1Q92949 421 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 SCAMP4Q969E2 229 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 HDAC10Q969S8 669 aa8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SGMS1-211ENST00000626236 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.48□□□□□ -1.05
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