RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARHGEF7Q14155 803 aa16.76■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ATG16L1Q676U5 607 aa16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 KLC3Q6P597 504 aa16.76■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 TPRG1Q6ZUI0 275 aa16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 PIH1D2Q8WWB5 315 aa16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.76■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.76■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A096LPK6 155 aa16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.75■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF528Q3MIS6 628 aa16.75■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 BRD9Q9H8M2 597 aa16.75■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 DYRK4Q9NR20 520 aa16.75■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 LAMTOR5O43504 91 aa16.74■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF30P17039 623 aa16.74■□□□□ 0.27
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TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM111AQ96PZ2 611 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 NELL2Q99435 816 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 DKK3Q9UBP4 350 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 PPIL1Q9Y3C6 166 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 SPO11Q9Y5K1 396 aa16.74■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 DCHS1Q96JQ0 3298 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOXO6A8MYZ6 492 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.73■□□□□ 0.27
TRAPPC3-210ENST00000617904 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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