RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 BOCQ9BWV1 1114 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 FGF22Q9HCT0 170 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PPIL1Q9Y3C6 166 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS38A1L453 326 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN8A6NHC0 703 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 B4DGG1 531 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TAF4O00268 1085 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF10CO14798 259 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN7O95471 211 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PRLP01236 227 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CAPNS1P04632 268 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GM2AP17900 193 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TGM2P21980 687 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CTNNA2P26232 953 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CETN2P41208 172 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CDKN2BP42772 138 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GNPDA1P46926 289 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SKOR1P84550 965 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CDK3Q00526 305 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PTSQ03393 145 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CAMK2BQ13554 666 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT3Q14435 633 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 QPCTQ16769 361 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TEX44Q53QW1 395 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RFLNAQ6ZTI6 216 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PID1Q7Z2X4 250 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KATNAL2Q8IYT4 538 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PELI3Q8N2H9 469 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CNTD1Q8N815 330 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SCAMP4Q969E2 229 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 OLFM3Q96PB7 478 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TEX101Q9BY14 249 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ABCG8Q9H221 673 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 UBP1Q9NZI7 540 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RAXQ9Y2V3 346 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 U3KQA8 63 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTS20P59510 1910 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MACROD2A1Z1Q3 448 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RCCD1A6NED2 376 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 H7C0C1 242 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 INPP4BO15327 924 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MTSS1O43312 755 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 USP12O75317 370 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CSO75390 466 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PMPCBO75439 489 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SLC4A1P02730 911 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PYGLP06737 847 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MMP2P08253 660 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PIRTP0C851 137 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ATP5OP48047 213 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 POLD2P49005 469 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 MARCKSL1P49006 195 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 STC1P52823 247 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 DPTQ07507 201 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KIF5AQ12840 1032 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 SPIDRQ14159 915 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 IHHQ14623 411 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 PERM1Q5SV97 790 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD16Q68DU8 428 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-214ENST00000583153 OR6C4Q8NGE1 309 aa8.29□□□□□ -1.08
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