RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581967.1

CTC1-210, Transcript of CST telomere replication complex component 1, humanhuman

TSL 4

Gene CTC1, Length 542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1-210ENST00000581967 VPS16Q9H269 839 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SP110Q9HB58 689 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 KCTD3Q9Y597 815 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 LRP4O75096 1905 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 A8MU76 341 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 DFFAO00273 331 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 EPHB6O15197 1021 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 DAPK3O43293 454 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 DLGAP3O95886 979 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PEX11BO96011 259 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 CPP00450 1065 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 DESP17661 470 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 ERCC2P18074 760 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 TCN2P20062 427 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 LHCGRP22888 699 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 STAT5AP42229 794 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 GPR1P46091 355 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 KLK7P49862 253 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 UBE2HP62256 183 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 OGDHQ02218 1023 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 MAP7Q14244 749 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 CA9Q16790 459 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PYCR3Q53H96 274 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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CTC1-210ENST00000581967 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 DENND2CQ68D51 928 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 DOK6Q6PKX4 331 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 NLRP8Q86W28 1048 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 LZTR1Q8N653 840 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 ESX1Q8N693 406 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 NPWQ8N729 165 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SLC38A3Q99624 504 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 NOD2Q9HC29 1040 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 DACH1Q9UI36 760 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SDK2Q58EX2 2172 aa6.5□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 K7EM74 188 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 MTSS1O43312 755 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PGLSO95336 258 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 MAP3K6O95382 1288 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 EML2O95834 649 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SOD1P00441 154 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PYGLP06737 847 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 TNFAIP3P21580 790 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 F8A1P23610 371 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 EPHA4P54764 986 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 HHEXQ03014 270 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 NFATC2Q13469 925 aa6.49□□□□□ -1.37
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CTC1-210ENST00000581967 DPYSQ14117 519 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 ZNF235Q14590 738 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 PTPRRQ15256 657 aa6.49□□□□□ -1.37
CTC1-210ENST00000581967 SYCP1Q15431 976 aa6.49□□□□□ -1.37
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