RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPN5P54829 565 aa29.03■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 STK40Q8N2I9 435 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TAS2R42Q7RTR8 314 aa29.01■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SIKE1Q9BRV8 207 aa29.01■■■□□ 2.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM96AQ9H5X1 160 aa29.01■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD49Q8WVL7 239 aa28.99■■■□□ 2.23
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
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