RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556591.1

CFAP54-208, Transcript of cilia and flagella associated protein 54, human

TSL 5

Gene CFAP54, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A1B0GUV1	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CLGN	O14967	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	EGF	P01133	1207 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	NFKBIA	P25963	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PCYT2	Q99447	389 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TULP2	O00295	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC16A5	O15375	505 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CLCNKA	P51800	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	NLRP5	P59047	1200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PDILT	Q8N807	584 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	FIG4	Q92562	907 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	IL17F	Q96PD4	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A087X0M5	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591		A0A1B0GX30	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TIPRL	O75663	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RARG	P13631	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CD53	P19397	219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	S1PR1	P21453	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	RRM1	P23921	792 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CHM	P24386	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	MAPK4	P31152	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	GAS1	P54826	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	GRIK2	Q13002	908 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	APBB2	Q92870	758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	PKP4	Q99569	1192 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	SCN5A	Q14524	2016 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CFAP54-208	ENST00000556591	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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