RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	PCCB	P05166	539 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	IGHV4-34	P06331	123 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	TSHR	P16473	764 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	BPI	P17213	487 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ITGAL	P20701	1170 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	CD27	P26842	260 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	NMBR	P28336	390 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ECHS1	P30084	290 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	PHB	P35232	272 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	MAGEA4	P43358	317 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	VSNL1	P62760	191 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	CREB5	Q02930	508 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	CRYM	Q14894	314 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM135	Q86UB9	458 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	DEFB119	Q8N690	84 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	EID2B	Q96D98	161 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	MFSD3	Q96ES6	412 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	SERAC1	Q96JX3	654 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	TTC1	Q99614	292 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	IL26	Q9NPH9	171 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	TREX1	Q9NSU2	369 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB23	Q9ULC3	237 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	KCTD3	Q9Y597	815 aa		12.47	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A1W2PPC4	97 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904		H7C0S8	307 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	PFDN6	O15212	129 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ERLIN1	O75477	346 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	VAPB	O95292	243 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	GSTA2	P09210	222 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	MC4R	P32245	332 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	DPP6	P42658	865 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR1	P46091	355 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ACVR1	Q04771	509 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	DPT	Q07507	201 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	CBLB	Q13191	982 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	PTPRCAP	Q14761	206 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	STAT4	Q14765	748 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	IRF4	Q15306	451 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	LONRF1	Q17RB8	773 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	PMS2CL	Q68D20	193 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	CES3	Q6UWW8	571 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	RELL1	Q8IUW5	271 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR26	Q8NDV2	337 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	CALML6	Q8TD86	181 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	SCAMP4	Q969E2	229 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	HDAC10	Q969S8	669 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF778	Q96MU6	729 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	MYOC	Q99972	504 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	ABCG8	Q9H221	673 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	WDR26	Q9H7D7	661 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		12.46	□□□□□ -0.41
ABCD4-223	ENST00000555904		A6NNZ2	444 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-223	ENST00000555904	CCL22	O00626	93 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-223	ENST00000555904	HR	O43593	1189 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-223	ENST00000555904	GNS	P15586	552 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-223	ENST00000555904	STX2	P32856	288 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-223	ENST00000555904	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-223	ENST00000555904	CACNG1	Q06432	222 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-223	ENST00000555904	NFATC2	Q13469	925 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-223	ENST00000555904	FGL2	Q14314	439 aa		12.45	□□□□□ -0.42
ABCD4-223	ENST00000555904	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		12.45	□□□□□ -0.42

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