RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-208	ENST00000547298	FLT3	P36888	993 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RGR	P47804	291 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	HHEX	Q03014	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CDK18	Q07002	472 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	IL11RA	Q14626	422 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SYVN1	Q86TM6	617 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	C9orf72	Q96LT7	481 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SVIL	O95425	2214 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	E2F3	O00716	465 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	P4HA2	O15460	535 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SOD1	P00441	154 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PTGER4	P35408	488 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	EPHA4	P54764	986 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PTK2	Q05397	1052 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	NFATC2	Q13469	925 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PEX6	Q13608	980 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SEC14L1	Q92503	715 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	GPR87	Q9BY21	358 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ZNF185	O15231	689 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	LRIG2	O94898	1065 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CMA1	P23946	247 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	MAPK9	P45984	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	SEPHS1	P49903	392 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	KRTAP10-9	P60411	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	GRM3	Q14832	879 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ACOX1	Q15067	660 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	GJB7	Q6PEY0	223 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	NUS1	Q96E22	293 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PDF	Q9HBH1	243 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298		A6NL46	340 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	MT-ND3	P03897	115 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TEAD1	P28347	426 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	ADRA1B	P35368	520 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PER3	P56645	1201 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	CNGA3	Q16281	694 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	DOK6	Q6PKX4	331 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-208	ENST00000547298	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62

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