RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	RELL1	Q8IUW5	271 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	HDAC10	Q969S8	669 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	DTD2	Q96FN9	168 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CERS2	Q96G23	380 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TTC1	Q99614	292 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TRIO	O75962	3097 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658		H7C0S8	307 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	VAPB	O95292	243 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PCCB	P05166	539 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	BPI	P17213	487 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SSTR1	P30872	391 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	NUDT1	P36639	197 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	GPR1	P46091	355 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CCR5	P51681	352 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PPP2CB	P62714	309 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PPP2CA	P67775	309 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PTPRCAP	Q14761	206 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC14	Q15048	493 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	KYNU	Q16719	465 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658		Q6ZVL8	140 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	OR4L1	Q8NH43	312 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	KLK6	Q92876	244 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FOXJ1	Q92949	421 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TBATA	Q96M53	351 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	COQ10A	Q96MF6	247 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF778	Q96MU6	729 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC77	Q9BR77	488 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ZFAT	Q9P243	1243 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CCL22	O00626	93 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SLC31A1	O15431	190 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	GPR37L1	O60883	481 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	AKT2	P31751	481 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	NUBP1	P53384	320 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ACVR1	Q04771	509 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CACNG1	Q06432	222 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	DMWD	Q09019	674 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	MGAT5	Q09328	741 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	ANGPT1	Q15389	498 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CEP68	Q76N32	757 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	GPR26	Q8NDV2	337 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDB1-223	ENST00000543658	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.84	□□□□□ -0.51

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