RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542438.1

RNF10-216, Transcript of ring finger protein 10, human

TSL 4

Gene RNF10, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF10-216	ENST00000542438	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TNFRSF10C	O14798	259 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SDC3	O75056	442 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	RASGRP1	O95267	797 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	METTL18	O95568	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	AGT	P01019	485 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	IFNB1	P01574	187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	DGKA	P23743	735 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ADRA1A	P35348	466 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	HMGCL	P35914	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	FDFT1	P37268	417 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	CHRNA4	P43681	627 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	DCDC1	P59894	354 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	CDK3	Q00526	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PELI3	Q8N2H9	469 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SCAMP4	Q969E2	229 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PAK5	Q9P286	719 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	AP2A1	O95782	977 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SOD1	P00441	154 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TNF	P01375	233 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SLC4A1	P02730	911 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ALPPL2	P10696	532 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	KCNA4	P22459	653 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	HK3	P52790	923 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	GLRX5	Q86SX6	157 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	HID1	Q8IV36	788 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	EID2B	Q96D98	161 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	LGR4	Q9BXB1	951 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24	5e-6	■■■■□ 22.4
RNF10-216	ENST00000542438	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	KLF15	Q9UIH9	416 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	MYLK	Q15746	1914 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438		E7EVH7	732 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	AURKA	O14965	403 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SCAMP1	O15126	338 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	AQP9	O43315	295 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TNFSF14	O43557	240 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	CTSE	P14091	401 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PDE1B	Q01064	536 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	LINC00523	Q86TU6	105 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	SLC25A45	Q8N413	288 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	EID2	Q8N6I1	236 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	LMX1A	Q8TE12	382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	COG1	Q8WTW3	980 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNF10-216	ENST00000542438	HIC2	Q96JB3	615 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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