RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 NR2E1Q9Y466 385 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 OR6C70A6NIJ9 312 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KLF11O14901 512 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CHADO15335 359 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 EDN1P05305 212 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 GPIP06744 558 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TMBIM6P55061 237 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ACTR3P61158 418 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CD83Q01151 205 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 HSF2Q03933 536 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SQLEQ14534 574 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 HPS6Q86YV9 775 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CNTD1Q8N815 330 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 DPF3Q92784 378 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 NXNL1Q96CM4 212 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PGBD4Q96DM1 585 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MED30Q96HR3 178 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CHST7Q9NS84 486 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 HAS3O00219 553 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ENDOD1O94919 500 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SMPD1P17405 629 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 HTR2BP41595 481 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ITKQ08881 620 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 FBXO43Q4G163 708 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 RTP4Q96DX8 246 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ACP6Q9NPH0 428 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 UBE2QL1A1L167 161 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 B4GALT5O43286 388 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ICMTO60725 284 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 HUS1O60921 280 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 POLBP06746 335 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 WNT7BP56706 349 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CDO1Q16878 200 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 SMUG1Q53HV7 270 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 STRADAQ7RTN6 431 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 POF1BQ8WVV4 589 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 AGAP3Q96P47 875 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 USP18Q9UMW8 372 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TTC34A8MYJ7 566 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 LRCH4O75427 683 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 CYP7B1O75881 506 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 HMBSP08397 361 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 NKX3-2P78367 333 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 TFAP2BQ92481 460 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRD-214ENST00000540109 HAVCR1Q96D42 359 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 ASIC4Q96FT7 647 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRD-214ENST00000540109 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.04□□□□□ -1.44
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