RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 IGSF22Q8N9C0 903 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PCDH19Q8TAB3 1148 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CEP192Q8TEP8 1941 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 USP7Q93009 1102 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 VOPP1Q96AW1 172 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CBWD1Q9BRT8 395 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CALN1Q9BXU9 219 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 GPR87Q9BY21 358 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SDCBP2Q9H190 292 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SMYD3Q9H7B4 428 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CASS4Q9NQ75 786 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 KLHL11Q9NVR0 708 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PISDQ9UG56 409 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 HMGXB4Q9UGU5 601 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SUN2Q9UH99 717 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PFDN2Q9UHV9 154 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
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CHMP4A-208ENST00000534106 SARDHQ9UL12 918 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 STYXL1Q9Y6J8 313 aa3.06□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MYLKQ15746 1914 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ARHGAP10A1A4S6 786 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PLD2O14939 933 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 NPC1O15118 1278 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SCAMP1O15126 338 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 RAD51BO15315 384 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 YKT6O15498 198 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 LATO43561 262 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MFAP3LO75121 409 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CDKL5O76039 1030 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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CHMP4A-208ENST00000534106 MPIG6BO95866 241 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 IL1BP01584 269 aa3.05□□□□□ -1.92
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CHMP4A-208ENST00000534106 GP1BAP07359 652 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ITGA2BP08514 1039 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
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CHMP4A-208ENST00000534106 GOT1P17174 413 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 KRT4P19013 534 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 APEX1P27695 318 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 GJB2P29033 226 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 DRD3P35462 400 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TUBP50607 506 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CASP5P51878 434 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF131P52739 623 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MAPK10P53779 464 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ADKP55263 362 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 BPIFB4P59827 614 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ASIC1P78348 528 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 ZBTB16Q05516 673 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CNTN1Q12860 1018 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 DEFB109BQ30KR1 87 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 FSCBQ5H9T9 825 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 KANK2Q63ZY3 851 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLFN12LQ6IEE8 588 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 FAM111BQ6SJ93 734 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 Q6ZSR6 202 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SPATC1Q76KD6 591 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 CBWD2Q8IUF1 395 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 FAM114A1Q8IWE2 563 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 BRSK2Q8IWQ3 736 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 UNC5BQ8IZJ1 945 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 RBFAQ8N0V3 343 aa3.05□□□□□ -1.92
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa3.05□□□□□ -1.92
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