RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519363.1

PABPC1-210, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 4

Gene PABPC1, Length 453 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-210ENST00000519363 NEK3P51956 506 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 STARD3Q14849 445 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 SDE2Q6IQ49 451 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 RAB7BQ96AH8 199 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 CABS1Q96KC9 395 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 CDH19Q9H159 772 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 BPIFA1Q9NP55 256 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 DYRK4Q9NR20 520 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.9□□□□□ -0.02
PABPC1-210ENST00000519363 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 A0A0U1RQS6 177 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 A6NNZ2 444 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 TPP1O14773 563 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 PRAMEF1O95521 474 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 IL1BP01584 269 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 PYGBP11216 843 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ADRB3P13945 408 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ITGALP20701 1170 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 PSMD8P48556 350 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SPINT3P49223 89 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SEC13P55735 322 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 PTSQ03393 145 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 CCINQ13939 588 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SEMA3AQ14563 771 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 GPR33Q49SQ1 333 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SNX20Q7Z614 316 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 TTC7BQ86TV6 843 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 OR2T3Q8NH03 318 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 IL26Q9NPH9 171 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SNX15Q9NRS6 342 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.89□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 AGAP14A8MT82 685 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 TM9SF1O15321 606 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ADAM23O75077 832 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 HAUS5O94927 633 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ZWINTO95229 277 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 MPOP05164 745 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 C5AR1P21730 350 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 PMLP29590 882 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ATP1A2P50993 1020 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 METAP1P53582 386 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 COPAP53621 1224 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ADARP55265 1226 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 SATB1Q01826 763 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 POU4F1Q01851 419 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 TFF2Q03403 129 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 PRKCQQ04759 706 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ZP2Q05996 745 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 CST6Q15828 149 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 IER5LQ5T953 404 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 CNSTQ6PJW8 725 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 LCA5Q86VQ0 697 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 FAM3CQ92520 227 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 LPGAT1Q92604 370 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 CENPTQ96BT3 561 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 CD248Q9HCU0 757 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.88□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 COPEO14579 308 aa14.87□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 AP1G1O43747 822 aa14.87□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 ELFN1P0C7U0 828 aa14.87□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 HOXB2P14652 356 aa14.87□□□□□ -0.03
PABPC1-210ENST00000519363 CHN1P15882 459 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms