RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516896.1

RNU6-175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-175P-201ENST00000516896 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MRAPQ8TCY5 172 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 AFAP1L1Q8TED9 768 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 AGAP11Q8TF27 550 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 NPRL2Q8WTW4 380 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZFAND2BQ8WV99 257 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RNF138Q8WVD3 245 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RND1Q92730 232 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SLCO2A1Q92959 643 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RNF183Q96D59 192 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 FAM122AQ96E09 287 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 APIPQ96GX9 242 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 AGAP4Q96P64 663 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SMC6Q96SB8 1091 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 KRT12Q99456 494 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 C16orf70Q9BSU1 422 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TRAIPQ9BWF2 469 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TRIM54Q9BYV2 358 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MAGEE1Q9HCI5 957 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PRDM11Q9NQV5 511 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CNGB3Q9NQW8 809 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TMEM30AQ9NV96 361 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SLC38A7Q9NVC3 462 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF446Q9NWS9 450 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 C1RLQ9NZP8 487 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 VPS51Q9UID3 782 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SLC12A4Q9UP95 1085 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MST1RQ04912 1400 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PCNX2A6NKB5 2137 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 NACAE9PAV3 2078 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PINLYPA6NC86 204 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 A8MZ25 164 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 E9PAM4 449 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF195O14628 629 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF197O14709 1029 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 OGTO15294 1046 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SLC25A17O43808 307 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 IGSF3O75054 1194 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SH3BGRLO75368 114 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CA11O75493 328 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 STAM2O75886 525 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ACTL6AO96019 429 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 KRT19P08727 400 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 FAM106CPP0CH98 169 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SRGAP2BP0DMP2 458 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MYBL2P10244 700 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 GP1BBP13224 206 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CSF2RAP15509 400 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF23P17027 643 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 BTF3P20290 206 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MSH3P20585 1137 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 UGT1A1P22309 533 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 NR2F2P24468 414 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SLC7A1P30825 629 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ATICP31939 592 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 DCTDP32321 178 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 OPRL1P41146 370 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 NR2C2P49116 596 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CRISP1P54107 249 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 WNT4P56705 351 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PFN3P60673 137 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MBTD1Q05BQ5 628 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 FAM27E3Q08E93 113 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ACVR2BQ13705 512 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 RUNX2Q13950 521 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 TAZQ16635 292 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF569Q5MCW4 686 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 CYP4A22Q5TCH4 519 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 ZNF691Q5VV52 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 KRT79Q5XKE5 535 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 FAAH2Q6GMR7 532 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 IGFL1Q6UW32 110 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-175P-201ENST00000516896 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.1 ms