RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF234Q14588 700 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC35G1Q2M3R5 365 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRIM65Q6PJ69 517 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHL17Q6TDP4 642 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MTSS1LQ765P7 747 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TAOK1Q7L7X3 1001 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POM121L12Q8N7R1 296 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF611Q8N823 705 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZMIZ2Q8NF64 920 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GJC3Q8NFK1 279 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 OR5R1Q8NH85 324 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SNAPC3Q92966 411 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RHBDF1Q96CC6 855 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MPHOSPH8Q99549 860 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CLSTN3Q9BQT9 956 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NUDT4Q9NZJ9 180 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 THEGQ9P2T0 379 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PADI3Q9ULW8 664 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A3GALT2U3KPV4 340 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HIVEP2P31629 2446 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ASNA1O43681 348 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NDUFB4O95168 129 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM106CPP0CH98 169 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACADMP11310 421 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FOLR2P14207 255 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEBPBP17676 345 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RPL17P18621 184 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EDN2P20800 178 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NFKBIAP25963 317 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WNT5AP41221 380 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MTHFRP42898 656 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AMPHP49418 695 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRIM2P49643 509 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MBTD1Q05BQ5 628 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PAX8Q06710 450 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PDCLQ13371 301 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DRP2Q13474 957 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C15orf32Q32M92 178 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TRIM60Q495X7 471 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GTDC1Q4AE62 458 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF280DQ6N043 979 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPP4R4Q6NUP7 873 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MOB3CQ70IA8 216 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CHD1LQ86WJ1 897 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NRSN1Q8IZ57 195 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ACVR1CQ8NER5 493 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRSS33Q8NF86 280 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TYMSOSQ8TAI1 123 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC2A12Q8TD20 617 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GDPD5Q8WTR4 605 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NEURL2Q9BR09 285 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COLEC11Q9BWP8 271 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CTDSP1Q9GZU7 261 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NUP62CLQ9H1M0 184 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GNB4Q9HAV0 340 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MMP25Q9NPA2 562 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PTTG2Q9NZH5 202 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NFU1Q9UMS0 254 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC6A5Q9Y345 797 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CLDN16Q9Y5I7 305 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 A0A087WW49 117 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CBY3A6NI87 242 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 AQP12BA6NM10 295 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IFNL4K9M1U5 179 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EBAG9O00559 213 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EML2O95834 649 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CLPTM1O96005 669 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CSF1P09603 554 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLA2G4BP0C869 781 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 FAM157CP0CG43 387 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 UGT1A4P22310 534 aa0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BDKRB2P30411 391 aa0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms