RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAGED4Q96JG8 741 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 CFAP57Q96MR6 1250 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP28Q96RU2 1077 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAAF1Q9BRP4 392 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 STK31Q9BXU1 1019 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 POLG2Q9UHN1 485 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A088AWK7 358 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASB14A6NK59 587 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 FCGR2AP12318 317 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 TBPP20226 339 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITGAXP20702 1163 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 CD34P28906 385 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSTM5P46439 218 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPR12P47775 334 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 RGRP47804 291 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLCNKAP51800 687 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPIAP62937 165 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 E2F5Q15329 346 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEAD2Q15562 447 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 HLA-BQ31612 363 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 VWA2Q5GFL6 755 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARHGEF16Q5VV41 709 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 REG3GQ6UW15 175 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP45Q70EL2 814 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRABD2AQ86V40 505 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 MON1AQ86VX9 555 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 DGKHQ86XP1 1220 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 HACE1Q8IYU2 909 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4N4Q8N0Y3 316 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10G8Q8NGN5 311 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC01006Q8NI28 216 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAGEC3Q8TD91 643 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERGIC1Q969X5 290 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 SIPA1Q96FS4 1042 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL21A1Q96P44 957 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIP5K1AQ99755 562 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLSTN3Q9BQT9 956 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 HAUS8Q9BT25 410 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 P2RY12Q9H244 342 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRDM11Q9NQV5 511 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q9UF83 564 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 JRKLQ9Y4A0 524 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A087WZ62 844 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A096LPK6 155 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A0U1RQK1 487 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2W5A6NFC9 320 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 NXPH2O95156 264 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 CYP3A4P08684 503 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM106CPP0CH98 169 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PNMTP11086 282 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTPS1P17812 591 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTPN3P26045 913 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 MMP12P39900 470 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLCN4P51793 760 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 TLE3Q04726 772 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 MBTD1Q05BQ5 628 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPS1Q13098 491 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ODF1Q14990 250 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATAT1Q5SQI0 421 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALS2CLQ60I27 953 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 RGMBQ6NW40 437 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PGM2L1Q6PCE3 622 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 KSR2Q6VAB6 950 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ABHD5Q8WTS1 349 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPM1EQ8WY54 764 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAXDC2Q96IV6 333 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 NEURL2Q9BR09 285 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 FZD8Q9H461 694 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 CERS4Q9HA82 394 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 MKS1Q9NXB0 559 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKRD10Q9NXR5 420 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-871P-201ENST00000516122 A8MXK9 166 aa-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms