RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	NFKBIA	P25963	317 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR2C2	P49116	596 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHB1	P54762	984 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GALNT3	Q14435	633 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC14A2	Q15849	920 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	KAZN	Q674X7	775 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM74	Q86UV6	250 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GKN2	Q86XP6	184 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	EXD1	Q8NHP7	514 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP2M1	Q96CW1	435 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NXPE2	Q96DL1	559 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEKT5	Q96M29	485 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLOD4	Q9HC38	313 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GULP1	Q9UBP9	304 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SUFU	Q9UMX1	484 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		12.66	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRINP1	O60477	761 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	IVL	P07476	585 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPR1	P46091	355 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPINT3	P49223	89 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPIA	P49247	311 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFDP2	Q14188	446 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP2R5E	Q16537	467 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ISX	Q2M1V0	245 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DAAM2	Q86T65	1068 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLMN	Q92990	594 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAT6	Q93015	286 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	HAUS1	Q96CS2	278 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	12.65	□□□□□ -0.38
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A087WV48	116 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PQM1	296 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGF1	P05230	155 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIRT	P0C851	137 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CA4	P22748	312 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTNNA2	P26232	953 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDC25B	P30305	580 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNPDA1	P46926	289 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	VAV2	P52735	878 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12.64	□□□□□ -0.39	1e-7	■□□□□ 9.5
SH3BP2-222	ENST00000512014	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	AADACL2	Q6P093	401 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDELC1	Q6UW63	502 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	BBS12	Q6ZW61	710 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALG3	Q92685	438 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		12.64	□□□□□ -0.39
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		12.64	□□□□□ -0.39

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