RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 FATE1Q969F0 183 aa24.59■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM159Q96B96 161 aa24.59■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 AP2M1Q96CW1 435 aa24.59■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 CDH19Q9H159 772 aa24.59■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.531e-8■■■■■ 46.7
ALYREF-203ENST00000511412 PISDQ9UG56 409 aa24.59■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 CAPN8A6NHC0 703 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 SOD1P00441 154 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 FGF1P05230 155 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 MX2P20592 715 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 SLC5A2P31639 672 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 TAS2R40P59535 323 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 PEX6Q13608 980 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 SLC18A3Q16572 532 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 SLC30A9Q6PML9 568 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 RFLNAQ6ZTI6 216 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 FAF2Q96CS3 445 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 TSGA13Q96PP4 275 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 SMIM14Q96QK8 99 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 ABCG8Q9H221 673 aa24.58■■□□□ 1.53
ALYREF-203ENST00000511412 RHPN2P1A8MT19 583 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 K7ENP7 123 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PYGLP06737 847 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 POLD2P49005 469 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 B4GALNT1Q00973 533 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 GBE1Q04446 702 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 BIRC2Q13490 618 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC81Q6ZN84 652 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF765Q7L2R6 523 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF438Q7Z4V0 828 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 SLITRK4Q8IW52 837 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 HDAC11Q96DB2 347 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 OR2M4Q96R27 311 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CMKLR1Q99788 373 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 DEF6Q9H4E7 631 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 WDR70Q9NW82 654 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CHKBQ9Y259 395 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 UNC13CQ8NB66 2214 aa24.57■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 MGAQ8IWI9 3026 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ZW10O43264 779 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ECEL1O95672 775 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 HLA-DQB2P05538 268 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 MAN1A1P33908 653 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ADCY8P40145 1251 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 STC1P52823 247 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CTBSQ01459 385 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PTSQ03393 145 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PHF19Q5T6S3 580 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PQLC3Q8N755 202 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 LPCAT1Q8NF37 534 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 SCAMP4Q969E2 229 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 WBP1Q96G27 269 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ACSL6Q9UKU0 697 aa24.56■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 AGRPO00253 132 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CPNE6O95741 557 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ITIH1P19827 911 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PTMSP20962 102 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ACTR1BP42025 376 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ACTR1AP61163 376 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CFHR1Q03591 330 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM14Q14142 442 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 IHHQ14623 411 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 NR1D2Q14995 579 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 AMZ1Q400G9 498 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM74Q86UV6 250 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PIM3Q86V86 326 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC13Q8IYE1 715 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CCNYQ8ND76 341 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ARRDC2Q8TBH0 407 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 LRRN4Q8WUT4 740 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 RDH14Q9HBH5 336 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PCDH9Q9HC56 1237 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ST14Q9Y5Y6 855 aa24.55■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 NVLO15381 856 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM253P0C7T8 217 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ALDH4A1P30038 563 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 OR1D5P58170 312 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 RPL26P61254 145 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 NIPAL4Q0D2K0 466 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 NLRP8Q86W28 1048 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 NRSN1Q8IZ57 195 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 NAGSQ8N159 534 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PATE1Q8WXA2 126 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJC7Q99615 494 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 SEMA6CQ9H3T2 930 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 DTLQ9NZJ0 730 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms