RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490417.6

SFXN4-208, Transcript of sideroflexin 4, human

TSL 2

Gene SFXN4, Length 952 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFXN4-208	ENST00000490417	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TJP3	O95049	919 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PDHA1	P08559	390 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	XRCC4	Q13426	336 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	C1orf61	Q13536	156 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TAZ	Q16635	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ALG11	Q2TAA5	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TEX101	Q9BY14	249 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	AMFR	Q9UKV5	643 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	GPR34	Q9UPC5	381 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PRSS38	A1L453	326 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PJA2	O43164	708 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	GCAT	O75600	419 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TCEA3	O75764	348 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	MT-CO3	P00414	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	APOC2	P02655	101 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	GIMD1	P0DJR0	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	LHCGR	P22888	699 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	SKOR1	P84550	965 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	CDK3	Q00526	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PTS	Q03393	145 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	CDK18	Q07002	472 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	BIRC2	Q13490	618 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	CDKN3	Q16667	212 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417		Q6ZVL8	140 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PEX26	Q7Z412	305 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	DKK4	Q9UBT3	224 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM202	A6NGA9	273 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417		H7C0C1	242 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	OPA1	O60313	960 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PTPN3	P26045	913 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ATP5O	P48047	213 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	STC1	P52823	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SFXN4-208	ENST00000490417	HIC2	Q96JB3	615 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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