RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 ABI3Q9P2A4 366 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MKLN1Q9UL63 735 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.93□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PRAC2D3DTV9 90 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SLC25A12O75746 678 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 AFPP02771 609 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CLEC3BP05452 202 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DGKAP23743 735 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ZBTB17Q13105 803 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DCST1Q5T197 706 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CPLX4Q7Z7G2 160 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CUZD1Q86UP6 607 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CNTROBQ8N137 903 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DNAAF4Q8WXU2 420 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CD101Q93033 1021 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ACOX2Q99424 681 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 FKRPQ9H9S5 495 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 EHD2Q9NZN4 543 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ACSL5Q9ULC5 683 aa5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 A0A1W2PS18 150 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 LILRA5A6NI73 299 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 IFITM10A6NMD0 228 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 IFNL4K9M1U5 179 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SNAP23O00161 211 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TGFB1I1O43294 461 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 JRKO75564 520 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 AMD1P17707 334 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 S1PR1P21453 382 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TERF1P54274 439 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ADIPOQQ15848 244 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DSTYKQ6XUX3 929 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TMTC3Q6ZXV5 915 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MAB21L3Q8N8X9 362 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DNASE2BQ8WZ79 361 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PKP4Q99569 1192 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 SIL1Q9H173 461 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 B4E171 279 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 VCYO14598 125 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DAB1O75553 588 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ZNF432O94892 652 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CAMTA2O94983 1202 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DDX58O95786 925 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 EGFP01133 1207 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CHMP24386 653 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MT3P25713 68 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ICAM3P32942 547 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TSPAN7P41732 249 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DLX5P56178 289 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MPP1Q00013 466 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TFAP4Q01664 338 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 MYLK3Q32MK0 819 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 DPPA4Q7L190 304 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 KMT5CQ86Y97 462 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ORAI1Q96D31 301 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 ARHGEF26Q96DR7 871 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 QRFPRQ96P65 431 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 EPYCQ99645 322 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PADI1Q9ULC6 663 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.9□□□□□ -1.46
USP34-216ENST00000487547 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 NDUFS3O75489 264 aa5.89□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 NKX2-2O95096 273 aa5.89□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.89□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 SLC20A2Q08357 652 aa5.89□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 ACSM2AQ08AH3 577 aa5.89□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 NIPAL4Q0D2K0 466 aa5.89□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 DECR1Q16698 335 aa5.89□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP34-216ENST00000487547 TTI2Q6NXR4 508 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms