RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CASP14P31944 242 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 POLD2P49005 469 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 MAZP56270 477 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SFTPA2Q8IWL1 248 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CCNYQ8ND76 341 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 FAM71BQ8TC56 605 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZMYND15Q9H091 742 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 BAHCC1Q9P281 2608 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PROSCO94903 275 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K6O95382 1288 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ASMTLO95671 621 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ECEL1O95672 775 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 GYPCP04921 128 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PTMSP20962 102 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ADCY8P40145 1251 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ACTR1BP42025 376 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 MAPK10P53779 464 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ACTR1AP61163 376 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CTBSQ01459 385 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 DSC2Q02487 901 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 PTPRRQ15256 657 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 OR2M4Q96R27 311 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 ABCG8Q9H221 673 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 CHKBQ9Y259 395 aa20.08■□□□□ 0.81
ACTB-212ENST00000484841 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.08■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 FZD6O60353 706 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 C1QL1O75973 258 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TPM1P09493 284 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 LIPCP11150 499 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ITIH1P19827 911 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ARSEP51690 589 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 OR1D5P58170 312 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 B4GALNT1Q00973 533 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ODF2Q5BJF6 829 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ZNF765Q7L2R6 523 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 NRROSQ86YC3 692 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ZNF843Q8N446 348 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 EXD1Q8NHP7 514 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 MAML1Q92585 1016 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 FATE1Q969F0 183 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TSGA13Q96PP4 275 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 RDH14Q9HBH5 336 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.07■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 BPTFQ12830 3046 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 AKR1B10O60218 316 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 GPR3P46089 330 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 PTSQ03393 145 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 MANEAQ5SRI9 462 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 USP53Q70EK8 1073 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 NLRP8Q86W28 1048 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 GALNT13Q8IUC8 556 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 USP7Q93009 1102 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SCAMP4Q969E2 229 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SEMA6CQ9H3T2 930 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 A0A0U1RQS6 177 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 INPP4BO15327 924 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CBFA2T2O43439 604 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 B4GAT1O43505 415 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 FUCA1P04066 466 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 TRIM14Q14142 442 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SLC18A3Q16572 532 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 HDAC11Q96DB2 347 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-212ENST00000484841 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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