RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.7■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.7■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.7■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 SLC25A13Q9UJS0 675 aa21.7■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CFAP73A6NFT4 308 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 OR1I1O60431 355 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 RBP1P09455 135 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 TFEBP19484 476 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 MPSTP25325 297 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 KCNC1P48547 511 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ECT2LQ008S8 904 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 TMEM215Q68D42 235 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ISCA2Q86U28 154 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 LSMEM2Q8N112 164 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 PAF1Q8N7H5 531 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 OTUB2Q96DC9 234 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 RSPRY1Q96DX4 576 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 RILPQ96NA2 401 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CDH19Q9H159 772 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 POMKQ9H5K3 350 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ALG9Q9H6U8 611 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 MARK1Q9P0L2 795 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 SCN8AQ9UQD0 1980 aa21.69■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ZBTB14O43829 449 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 RASSF9O75901 435 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 SRP72O76094 671 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CD1DP15813 335 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 TTPAP49638 278 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 IDH3AP50213 366 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 PTPRNQ16849 979 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ACCSLQ4AC99 568 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 FAM91A1Q658Y4 838 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 AGR3Q8TD06 166 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 PTERQ96BW5 349 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CAPN8A6NHC0 703 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 A8MT66 165 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 RHOBTB1O94844 696 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 NRIP1P48552 1158 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 DNAJB13P59910 316 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CEP44Q9C0F1 390 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 LRMDAQ9H2I8 198 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 FAM50BQ9Y247 325 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CLDN7O95471 211 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 DMC1Q14565 340 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CARD16Q5EG05 197 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 GALPQ9UBC7 116 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 C5orf42Q9H799 3197 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 H3BMM5 538 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 VIPR2P41587 438 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CACNG1Q06432 222 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 SULT2A1Q06520 285 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ASPHQ12797 758 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 KRT72Q14CN4 511 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 DUSP6Q16828 381 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CTSL3PQ5NE16 218 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 Q6ZVU0 165 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 TAS2R42Q7RTR8 314 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CCDC68Q9H2F9 335 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 COG4Q9H9E3 785 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.67■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CAPN14A8MX76 684 aa21.66■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 A8MX80 341 aa21.66■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
USP13-202ENST00000482333 CA5AP35218 305 aa21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms