RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 PSME2Q9UL46 239 aa13.52□□□□□ -0.25
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SH3BP1-206ENST00000469947 SOCS7O14512 581 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 LDLRP01130 860 aa13.51□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TXNP10599 105 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
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SH3BP1-206ENST00000469947 RCVRNP35243 200 aa13.51□□□□□ -0.25
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SH3BP1-206ENST00000469947 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa13.5□□□□□ -0.25
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SH3BP1-206ENST00000469947 C17orf50Q8WW18 174 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM125Q96AQ2 219 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 PTERQ96BW5 349 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 TKTL2Q9H0I9 626 aa13.5□□□□□ -0.25
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SH3BP1-206ENST00000469947 MYLKQ15746 1914 aa13.5□□□□□ -0.25
SH3BP1-206ENST00000469947 C19orf81C9J6K1 198 aa13.49□□□□□ -0.25
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