RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466405.1

WDR48-208, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDR48, Length 4,925 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-208ENST00000466405 TNFSF9P41273 254 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CDC42P60953 191 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ATP6V0D1P61421 351 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 UGCGQ16739 394 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 BRINP3Q76B58 766 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 SPATA19Q7Z5L4 167 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ZNF597Q96LX8 424 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 SLC29A1Q99808 456 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 PXMP2Q9NR77 195 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 RIMS3Q9UJD0 308 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 NENFQ9UMX5 172 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 TMX2Q9Y320 296 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 BTN3A1O00481 513 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 KCNQ2O43526 872 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 RASAL1O95294 804 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 F9P00740 461 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CCR1P32246 355 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CPOXP36551 454 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ALDH3A2P51648 485 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 OGDHQ02218 1023 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 FAM187BQ17R55 369 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 TBRG1Q3YBR2 411 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 BICRALQ6AI39 1079 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CNSTQ6PJW8 725 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CASP12Q6UXS9 341 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 STAG3L4Q8TBR4 150 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 SSR3Q9UNL2 185 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 IL1R1P14778 569 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ITGB5P18084 799 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 SEMA5AQ13591 1074 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ZNF460Q14592 562 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 TTC23LQ6PF05 361 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 PIK3C3Q8NEB9 887 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 MYLPFQ96A32 169 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 SLC22A4Q9H015 551 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CLN6Q9NWW5 311 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 TAS2R13Q9NYV9 303 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 H0YAE9 185 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 SSNA1O43805 119 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 XYLBO75191 536 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 C7P10643 843 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 MYL12AP19105 171 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 PROZP22891 400 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 PIGFQ07326 219 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ADIGQ0VDE8 80 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 MADCAM1Q13477 382 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 Q3C1V9 767 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ERAP2Q6P179 960 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 OR9I1Q8NGQ6 314 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ZNF384Q8TF68 577 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 TFAP2BQ92481 460 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 FCGR1BQ92637 280 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 LRRC58Q96CX6 371 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 ABCB9Q9NP78 766 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 NT5MQ9NPB1 228 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
WDR48-208ENST00000466405 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms