RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 DPTQ07507 201 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 CLCA4Q14CN2 919 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 OR4D9Q8NGE8 314 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PPIL1Q9Y3C6 166 aa22.55■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.22e-8■■■■□ 21
USP4-208ENST00000464168 SOD1P00441 154 aa22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ARL4AP40617 200 aa22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 BIRC2Q13490 618 aa22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 CSPG4P5Q96PW8 444 aa22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa22.54■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 CTPS1P17812 591 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 MPSTP25325 297 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 CSF2RBP32927 897 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ACTR1BP42025 376 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ACTR1AP61163 376 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PEX6Q13608 980 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ASIC2Q16515 512 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 BOLA3Q53S33 107 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ARMC12Q5T9G4 340 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 DOK6Q6PKX4 331 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 USP45Q70EL2 814 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 BBS5Q8N3I7 341 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 AGBL5Q8NDL9 886 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ART4Q93070 314 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ZNF653Q96CK0 615 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SMIM14Q96QK8 99 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ABCG8Q9H221 673 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 TMEM9Q9P0T7 183 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 SCINQ9Y6U3 715 aa22.53■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PDHA1P08559 390 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 THRAP10827 490 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 MMP13P45452 471 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 GPR1P46091 355 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ATP1A2P50993 1020 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 MARC1Q5VT66 337 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 HSPH1Q92598 858 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 CDH19Q9H159 772 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 CD84Q9UIB8 345 aa22.52■■□□□ 1.2
USP4-208ENST00000464168 PPFIA2O75334 1257 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 RARAP10276 462 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 UGT1A3P35503 534 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 PRKCIP41743 596 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 CDH6P55285 790 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 PTSQ03393 145 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 PYCR3Q53H96 274 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 SCAMP4Q969E2 229 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 AP2M1Q96CW1 435 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 OR2M4Q96R27 311 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 DPYSL5Q9BPU6 564 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 DDA1Q9BW61 102 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 OCIAD1Q9NX40 245 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 SLC39A1Q9NY26 324 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 LRRK2Q5S007 2527 aa22.51■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 FZD6O60353 706 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 MYBL1P10243 752 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 LRRC66Q68CR7 880 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 TMEM71Q6P5X7 295 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 TRIM74Q86UV6 250 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 TEX26Q8N6G2 289 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 IL22RA1Q8N6P7 574 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 ISCUQ9H1K1 167 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 NT5MQ9NPB1 228 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 PDP2Q9P2J9 529 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 NBASA2RRP1 2371 aa22.5■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.49■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 B4E171 279 aa22.49■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 LIFP15018 202 aa22.49■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 TSPAN7P41732 249 aa22.49■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 FASLGP48023 281 aa22.49■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 GPLD1P80108 840 aa22.49■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.49■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 IHHQ14623 411 aa22.49■■□□□ 1.19
USP4-208ENST00000464168 BORAQ6PGQ7 559 aa22.49■■□□□ 1.19
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