RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC1Q99614 292 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ARFGAP3Q9NP61 516 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR33A8MZF0 331 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PFDN6O15212 129 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP3K13O43283 966 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 RIPK2O43353 540 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR37L1O60883 481 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ACSL3O95573 720 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GOT2P00505 430 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TDGF1P13385 188 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGALP20701 1170 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SSTR1P30872 391 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 MC4RP32245 332 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FNTBP49356 437 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ARSDP51689 593 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GPX6P59796 221 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CACNG1Q06432 222 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 DPTQ07507 201 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 MGAT5Q09328 741 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGA9Q13797 1035 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPRCAPQ14761 206 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC14Q15048 493 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF528Q3MIS6 628 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR33Q49SQ1 333 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 NEPROQ6NW34 567 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TSSK4Q6SA08 328 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNMB4Q86W47 210 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR26Q8NDV2 337 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4L1Q8NH43 312 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXJ1Q92949 421 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 AP2M1Q96CW1 435 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CERS2Q96G23 380 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC77Q9BR77 488 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR174Q9BXC1 333 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FUT8Q9BYC5 575 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCG8Q9H221 673 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 IL26Q9NPH9 171 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CD93Q9NPY3 652 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.36□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 LATO43561 262 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIOO75962 3097 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 FSBPO95073 299 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAMEF1O95521 474 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GM2AP17900 193 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ARNTP27540 789 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 TEAD1P28347 426 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PMLP29590 882 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 AKT2P31751 481 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 CNR2P34972 360 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 HSD17B3P37058 310 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR1P46091 355 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP2CBP62714 309 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP2CAP67775 309 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 XIAPP98170 497 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
SH3BP4-208ENST00000462602 NFATC2Q13469 925 aa9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms