RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF302Q9NR11 478 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 CA14Q9ULX7 337 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 DUSP12Q9UNI6 340 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 R4GN57 208 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.66□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 APOL1O14791 398 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 FGF2P09038 288 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 EGR1P18146 543 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIF5BP33176 963 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 STAT6P42226 847 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 GNAQP50148 359 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC26A2P50443 739 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 GAB1Q13480 694 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 TDGQ13569 410 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 CSHL1Q14406 222 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 CEP55Q53EZ4 464 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 RHPN2Q8IUC4 686 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 VPS52Q8N1B4 723 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAR2Q96K12 515 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 RTP3Q9BQQ7 232 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZBP1Q9H171 429 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP53-201ENST00000454716 COL1A2P08123 1366 aa5.65□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A0U1RQF3 1178 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A1W2PPC4 97 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM86B1E9PN63 330 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRC1O43663 620 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM86B2P0C5J1 330 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 TSHRP16473 764 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 STT3AP46977 705 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CASP5P51878 434 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 PTPN14Q15678 1187 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 C6orf10Q5SRN2 563 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CASC1Q6TDU7 716 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMTC3Q6ZXV5 915 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 DCLK2Q8N568 766 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 IGSF21Q96ID5 467 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 LRRC2Q9BYS8 371 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 RIC8AQ9NPQ8 531 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 DENND4AQ7Z401 1863 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CCDC69A6NI79 296 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 KPNA5O15131 536 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 GALTP07902 379 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CNPP09543 421 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 SP9P0CG40 484 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 DARSP14868 501 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CHMLP26374 656 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CIITAP33076 1130 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC11A1P49279 550 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 GPC3P51654 580 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CLCN4P51793 760 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 NAPAP54920 295 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 DRP2Q13474 957 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 LETM2Q2VYF4 491 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 SPECC1Q5M775 1068 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 TTC22Q5TAA0 569 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 PLA2G4DQ86XP0 818 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAP7D2Q96T17 732 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF577Q9BSK1 485 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 TBC1D17Q9HA65 648 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 TBC1D13Q9NVG8 400 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CACNA1BQ00975 2339 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 EVPLQ92817 2033 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 CEP250Q9BV73 2442 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 SMCO2A6NFE2 343 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP53-201ENST00000454716 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms