RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430445.1

RAB17-208, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB17, Length 421 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-208	ENST00000430445	PSMD11	O00231	422 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	FASLG	P48023	281 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	MC2R	Q01718	297 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	PLAA	Q9Y263	795 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB17-208	ENST00000430445	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PSMA2	P25787	234 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	NFKBIA	P25963	317 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	GPR1	P46091	355 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	DPT	Q07507	201 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	ABHD18	Q0P651	414 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF235	Q14590	738 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PTPRR	Q15256	657 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	KRT31	Q15323	416 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	OR10G6	Q8NH81	332 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	STARD8	Q92502	1023 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PEBP4	Q96S96	227 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	EML2	O95834	649 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	SOD1	P00441	154 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	MAN1A1	P33908	653 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TRAF2	Q12933	501 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	SEPT6	Q14141	434 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PYCR3	Q53H96	274 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	MIB2	Q96AX9	1013 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	SCRN2	Q96FV2	425 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445		A0A0U1RQS6	177 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	BLACE	A4D250	179 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	STK17B	O94768	372 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PGLS	O95336	258 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	PEX11B	O96011	259 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TPM2	P07951	284 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	CTPS1	P17812	591 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TCN2	P20062	427 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	MC1R	Q01726	317 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	KLRB1	Q12918	225 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	LRP8	Q14114	963 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RAB17-208	ENST00000430445	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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