RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 UCNP55089 124 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CLN3Q13286 438 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 AMZ1Q400G9 498 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 PHF19Q5T6S3 580 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 PCSK4Q6UW60 755 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 LRRC49Q8IUZ0 686 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CCNYQ8ND76 341 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ARRDC2Q8TBH0 407 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 RAPGEF5Q92565 580 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 FAF2Q96CS3 445 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ST14Q9Y5Y6 855 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ATRXP46100 2492 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 BPTFQ12830 3046 aa15.49■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 LRRD1A4D1F6 860 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CAPN8A6NHC0 703 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 AKR1B10O60218 316 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CLDN7O95471 211 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ECEL1O95672 775 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 FGF1P05230 155 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 IVLP07476 585 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 KRT10P13645 584 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 PNLIPP16233 465 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 KDELR1P24390 212 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 SLC5A2P31639 672 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ADCY8P40145 1251 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 OR1D5P58170 312 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 B4GALNT1Q00973 533 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CTBSQ01459 385 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 PTSQ03393 145 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 DPTQ07507 201 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 VAC14Q08AM6 782 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 BIRC2Q13490 618 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 MAP7D3Q8IWC1 876 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CCDC13Q8IYE1 715 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 HDAC11Q96DB2 347 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 OR2M4Q96R27 311 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CEP41Q9BYV8 373 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 RDH14Q9HBH5 336 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 DTLQ9NZJ0 730 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 RHPN2P1A8MT19 583 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 KCNK1O00180 336 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ASMTLO95671 621 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 PRLP01236 227 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 TMEM253P0C7T8 217 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZNF30P17039 623 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 MX2P20592 715 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 TEAD1P28347 426 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ALDH4A1P30038 563 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 MAN1A1P33908 653 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ETV5P41161 510 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ACTR1BP42025 376 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CD86P42081 329 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 STC1P52823 247 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 MAPK10P53779 464 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ACTR1AP61163 376 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 NAGSQ8N159 534 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 TSGA13Q96PP4 275 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 RNF157Q96PX1 679 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 DNAJC7Q99615 494 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CHP1Q99653 195 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CDH19Q9H159 772 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 SDK2Q58EX2 2172 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CBFA2T2O43439 604 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 B4GAT1O43505 415 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 JCHAINP01591 159 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 KRT1P04264 644 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 TNNT1P13805 278 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 PTMSP20962 102 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 CA4P22748 312 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZBTB17Q13105 803 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 TRIM14Q14142 442 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 GALNT3Q14435 633 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTB-202ENST00000414620 TGIF1Q15583 401 aa15.46■□□□□ 0.07
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