RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 C22orf39Q6P5X5 142 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SYCE2Q6PIF2 218 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 AFTPHQ6ULP2 937 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PIGWQ7Z7B1 504 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD6LQ8IWD5 586 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MDGA1Q8NFP4 955 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13C4Q8NGS5 318 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PIH1D2Q8WWB5 315 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO19Q96H55 970 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM83CQ9BQN1 747 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCD4Q9BRC7 762 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CIPCQ9C0C6 399 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF576Q9H609 170 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ECT2Q9H8V3 914 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CATSPERZQ9NTU4 200 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MID2Q9UJV3 735 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 VWA7Q9Y334 891 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SPO11Q9Y5K1 396 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SHROOM3Q8TF72 1996 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0J9YYE9 177 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC162PA2VCL2 907 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFS3O75489 264 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBC1P01850 177 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKCGP05129 697 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 APOA4P06727 396 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CISD3P0C7P0 127 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGB7P26010 798 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 STK19P49842 368 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB10P61026 200 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MPP1Q00013 466 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 DMTNQ08495 405 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 POU4F2Q12837 409 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PPM1JQ5JR12 505 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 USP45Q70EL2 814 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CPA6Q8N4T0 437 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GPATCH11Q8N954 259 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC197Q8NCU1 140 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6K2Q8NGY2 324 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC8Q8TAM2 541 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 LRIG1Q96JA1 1093 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ELMO2Q96JJ3 720 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 HEPHQ9BQS7 1158 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC68Q9H2F9 335 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 EBF3Q9H4W6 596 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ELOVL2Q9NXB9 296 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GGT7Q9UJ14 662 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087X1B8 175 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 WASH3PC4AMC7 463 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MEN1O00255 615 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 KLF11O14901 512 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 AURKAO14965 403 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01565O15544 149 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PLIN3O60664 434 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TULP3O75386 442 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ARSAP15289 507 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMC3P17980 439 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 ALDH3A1P30838 453 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC26A3P40879 764 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 MTHFRP42898 656 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TTPAP49638 278 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 E2F5Q15329 346 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GEN1Q17RS7 908 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM83EQ2M2I3 478 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM68Q6AZZ1 485 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GRAMD4Q6IC98 578 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 TANGO2Q6ICL3 276 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 BRAT1Q6PJG6 821 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CNSTQ6PJW8 725 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 GDPD4Q6W3E5 623 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CERS6Q6ZMG9 384 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 EP400NLQ6ZTU2 488 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CMC1Q7Z7K0 106 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGGTB-201ENST00000319942 CD163Q86VB7 1156 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms