RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 RRADP55042 308 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 AP1S1P61966 158 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP11AP98196 1134 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK3Q00526 305 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 KIR2DS5Q14953 304 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CDO1Q16878 200 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 UGT8Q16880 541 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 NADK2Q4G0N4 442 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 STRADAQ7RTN6 431 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SRLQ86TD4 932 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SYVN1Q86TM6 617 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R3BQ86XI6 285 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 NRROSQ86YC3 692 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMK1DQ8IU85 385 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 HSCBQ8IWL3 235 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 BBS5Q8N3I7 341 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SFRP1Q8N474 314 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SHC3Q92529 594 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 TM9SF4Q92544 642 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 LGR4Q9BXB1 951 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 C2CD3Q4AC94 2353 aa7.83□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 I6L893 689 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 K7EM74 188 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 INSIG1O15503 277 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 RASSF9O75901 435 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K6O95382 1288 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ALPPP05187 535 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 AMD1P17707 334 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 HTR7P34969 479 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 FLT3P36888 993 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 AIF1P55008 147 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 NFATC2Q13469 925 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 PNOCQ13519 176 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 MANEALQ5VSG8 457 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 DOK6Q6PKX4 331 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 XYLT1Q86Y38 959 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 PATE1Q8WXA2 126 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 NTAN1Q96AB6 310 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 OR6C1Q96RD1 312 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNK17Q96T54 332 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ING2Q9H160 280 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SP110Q9HB58 689 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 APMAPQ9HDC9 416 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ACP6Q9NPH0 428 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 LHX9Q9NQ69 397 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 NDFIP2Q9NV92 336 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 C5AR2Q9P296 337 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 LHX3Q9UBR4 397 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.82□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 MED13Q9UHV7 2174 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRA5A6NI73 299 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ARGFXA6NJG6 315 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 SOCS5O75159 536 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ASMTLO95671 621 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF5P12034 268 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP11B1P15538 503 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 F8A1P23610 371 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGA3P26006 1051 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 VIPR1P32241 457 aa7.81□□□□□ -1.16
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
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